在談判傳出佳音的同時，特朗普25日釋放強硬信號，他在社交平台強調，協議必須對各方公平有利，否則美方將重返戰場，軍事行動的規模與烈度將遠超此前。美方官員透露，若最終協議不符合美國及其盟友利益，美軍已做好恢復對伊軍事打擊、重啟空襲的準備。伊朗則提出附加條件，要求美方解除對伊朗港口的封鎖，並推動以色列停止針對黎巴嫩真主黨的軍事行動，作為協議進一步推進的前提。
美軍同日以 「自衛」 為由對伊朗南部目標發起軍事打擊，打擊範圍覆蓋伊朗革命衛隊布雷船與導彈發射場。與此同時，美伊談判取得局部進展但未即刻達成協議，伊朗最高領導層因安全戒備藏身地下碉堡，通訊流程繁瑣拖慢談判節奏，波斯灣地區呈現邊談邊打的複雜態勢。
美軍中央司令部25日發布聲明稱，此次打擊屬自衛行動，旨在保護美軍部隊免受伊朗方面的直接威脅，打擊目標為伊朗南部的布雷船隻與導彈發射設施。霍斯新聞援引美國官員消息披露，美軍在霍爾木茲海峽發現兩艘伊朗革命衛隊船隻實施布雷作業，隨即對其完成殲滅打擊；同時精准打擊了伊朗阿巴斯港一處針對美軍戰機的地對空導彈陣地。美方強調，此次行動為防禦性打擊，並不意味著美伊現有停火終止。伊朗邁赫爾通訊社消息顯示，阿巴斯港當日傳出多起爆炸，當地官方隨後表示局勢已受控，民眾無需擔憂。
談判進程方面，伊朗外交部發言人巴蓋伊證實，美伊在談判多數議題上已達成結論，但不會立即簽署協議。據悉，伊朗高層安全戒備成為談判放緩的重要誘因。
美國情報官員透露，伊朗最高領袖穆傑塔巴目前藏身於未公開地點，幾乎與外界完全隔絕，並透過複雜的信使網絡傳遞訊息。由於聯繫程序極度繁瑣，美伊談判回應速度也因此明顯放緩。
CBS根據多名知情美國官員說法，目前伊朗政府高層已全面進入高度戒備狀態，多數領導人長時間躲藏于高度加固的地下碉堡內，甚至數周不見天日。除非絕對必要，否則彼此之間也盡量避免直接聯繫。其中一名官員形容：「看著他們試圖想辦法互相溝通，幾乎像是在看情境喜劇。他們已經徹底被逼瘋了。」
伊朗衛生部發言人指，最高領袖穆傑塔巴2月底在美以空襲中受傷後，曾在醫院接受治療，只是受皮外傷，翌日已出院。但CBS指，目前伊朗最高領袖本人採取最嚴格的保密措施。即便是伊朗政府最高層官員，也不知道他實際身處何地，更無法直接與其聯繫。
消息人士表示，所有訊息都必須透過一套特別設計的信使系統轉交，而這套機制的核心目的，就是避免外界追縱最高領袖位置。
美國官員指出，這也成為目前美伊談判進展緩慢的重要原因之一。當美方向伊朗提出新的協議內容後，由於相關訊息需層層轉交給最高領袖，再等待其指示返回，因此經常出現長時間延遲。
一名官員示：「這也是為甚麼你會看到有人說，『最高領袖已同意協議框架』，或者『正在等待最終協議細節回覆』。因為他收到的每一份資訊其實都已經過時，而他的回應也存在很大的延遲。」