柏克萊加大遭美國伊斯蘭關係委員會（CAIR）指控近年「有系統性打壓反種族滅絕言論」，被列為「敵對校園」，但校方強調一直致力維護言論自由的表達。
CAIR指出，將柏克萊加大列為「敵對校園」的理由，包括校內出現「長期針對巴勒斯坦人、穆斯林、阿拉伯和發聲反對以色列對加沙種族滅絕的學生與教職員的現象，且這種現象不斷升級」。
CAIR特別提到柏克萊加大過去多年的例子，包括2016年開學後一周暫停一門題為《巴勒斯坦︰一項殖民分析》（Palestine: A Settler Colonial Analysis）、2024年包括一名學生在內多名民眾為巴人權利抗議後遭逮捕和同年學生開始組織為加沙衝突組織營地後更新言論自由政策等。
CAIR加州分會2024年一份報告指出，該校有85%穆斯林學生曾遭受仇視伊斯蘭的騷擾，是同報告接受問卷調的87所學校中比例最高的。
CAIR研究及倡議專員哈桑（Maryam Hasan）認為，柏克萊加大在言論自由方面建立聲譽，但「當談論巴勒斯坦時明顯出現歧視性的例外」。他批評，大學高層處分為加沙爭取人權的學生，「不僅是懦弱，還是不公正的同謀」。
CAIR是全國最大穆斯林民權及倡議組織，旨在鼓勵外界多了解伊斯蘭，並為國內穆斯林爭取更多權益。
柏克萊加大是被CAIR列為「敵對校園」的28所美國大學之一。其他「榜上有名」的兩所加大分別是洛杉磯和爾灣加大。
柏克萊加大發言人莫古洛夫（Dan Mogulof）表示，校方正與校內「穆斯林及巴勒斯坦學生生活及校園體驗諮詢委員會」委員密切合作，以更好理解和解決穆斯林和巴勒斯坦社群的需要和利益。
莫古洛夫強調，校方致力於捍衛言論自由，並有效解決各種形式的騷擾和歧視，且全力支持一座「不管身份、出身或信仰如何，人人都能蓬勃發展，並能感受到真正歸屬感的社區」。灣區城市新聞社電
