新冠病毒Omicron變種在南非出現後，歐洲、亞洲等多個國家和地區迅速發現其蹤跡，但美國相隔5天後，才在本月1日發現首宗病例，令人質疑國家的檢測水平落後於人。專家表示，病毒基因測序技術其實已有明顯改善，但仍然存在盲點和瓶頸，因此造成了這個現象。
《紐約時報》報道，專家談到這次追查Omicron的工作時，表示全美的病毒基因測序已有很大進展，去年疫情爆發初期，每周只能處理3000個樣本，比例不到整體確診數字的1%，但現在已增至每周8萬。病毒專家貝德福（Trevor Bedford）解釋，基因測序必須達到一定數量才有效果，但實驗室從取得病人樣本到完成測序，整個過程需時10天，中間難免出現延誤，此外部分州府人手和資源有限，檢測時間更長，例如俄亥俄州衛生部門便表示，由採樣至測序完成需要最少3至4周。
另一個原因是，實驗室會優先處理外遊人士來美的確診個案，藉此防範境外輸入。以這次加州的首宗Omicron個案為例，當事人上月22日由南非返美，1星期後確診，相隔兩天科學家便檢測出Omicron病毒株。對此貝德福表示，可見國家的基因測序能力已有明顯改善。雖然檢測體系的運作開始暢順，但不同州份之間仍然存在差距，可能拖慢發現新病毒株的速度。在過去3個月，佛蒙特和麻省的測序數字，分別佔當地病例的30%及20%，但肯塔基和賓州等地的比例卻不足3%。
內布拉斯加大學醫學中心的基因傳染病學家福弗（Joseph Fauver）表示，還有一個原因是，不少民眾經過家居快速測試發現確診後，沒有進一步進行病毒分子檢測（P.C.R.），使得科學家無法收集樣本，這個也成為測序工作的盲點。專家盼望，全球限制南非的航班後，或能減慢Omicron傳播的速度，為美國爭取寶貴時間。
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